司法及法制委員會明（15）日邀請司法院秘書長、法務部部長率所屬相關單位列席就「總統行使特赦後，該案未沒收之不法所得及停審未定讞案件之處理」進行專題報告。報告書指出，陳水扁目前因身體因素，停審、尚未審結共有4案，都無法特赦，而未沒收的款項，也不在特赦範圍內。
根據法務部報告指出，赦免法第6條第1項及第7條規定，特赦程序包括總統命令行政院轉達法務部進行研議，研議後的建議交由行政院呈報給總統，總統決定是否行使特赦權以及對象。
法務部進一步指出，特赦後，總統頒發特赦令，行政院再轉達法務部處理後續程序。特赦對象為受罪刑宣告之人，特赦可使其免除刑罰執行或使宣告無效。
法務部表示，在犯罪所得部分，特赦權僅限於刑罰方面，而按犯罪所得，屬於犯罪行為人者，沒收之，也指出未經判決確定的案件不在特赦範圍內，需由審判機關依法處理。
